协商不成的，去起诉。1、可以去工程所在地或被告所在地人民起诉，管辖应该是区或者县人民。2、拖欠工程款属于民事纠纷，清欠办只负责农民工工资，所以应该在应付工程款之日起两年内到起诉。凭借欠条可以直接起诉建设单位，但是应当尽可能提供施工合同，竣工结算文件。3、起诉时尽量申请财产保全，查封被告名下账户，可以保障案件判决的顺利执行。4、部门可以调处工程款的支付问题，但对拖欠工程款的问题没有裁判权，强制权。但如果是工程，可以向建设该工程的要求支付或者处理。
法律依据
《民事诉讼法》第一百二十三条
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